Radne skupine se sastoje od članova partnerskog vijeća te stručnih osoba za pojedina područja i sektore. Radne skupine sastaju se radi savjetovanja, predlaganja i usmjeravanja procesa izrade Strategije.
Rješenjem gradonačelnika Grada Splita su osnovane sljedeće četiri radne skupine za izradu Strategije razvoja Urbane aglomeracija Split:
- Radna skupina „Održivi rast“,
- Radna skupina „Pametan rast“,
- Radna skupina „Uključivi rast“ i
- Radna skupina „Ruralni razvoj“
Prvi sastanci Radnih skupina su održani u prosincu 2015. godine na kojima se raspravljalo o analizi Strategije razvoja Urbane aglomeracije Split po tematskim područjima.